The unit of Molecular Pathology at the Department of Pathology and Molecular Pathology at the University Hospital Zurich, is a leading unit for developments in precision medicine including tumor genomics and multi-omics data integration. The diagnostic analyses include numerous modern omics-methods and cutting edge technologies: Whole genome sequencing, bulk RNA sequencing, methylation array, digital pathology, panel sequencing. Our scientists analyze the raw data of these assays to create diagnostic reports, develop new methods and support research projects.
Your main tasks
- Independent analysis, quality control, and interpretation of NGS and multi-omics data in a diagnostic setting
- Development, validation, and implementation of bioinformatics pipelines for routine molecular diagnostics
- Immunogenomics analyses with clinically relevant interpretation
- Application of machine learning / AI methods to omics data, with emphasis on robustness and interpretability
- Translation of new methods into routine diagnostics, including documentation and validation
- Preparation of clinical reports in collaboration with pathologists and molecular biologists
- Support in training medical and laboratory staff in data interpretation and bioinformatics workflows
Your profile
- MSc or PhD in Bioinformatics, Computational Biology, Medical Informatics, or a related field
- Strong experience in NGS/omics data analysis in an applied setting
- Proficiency in Python and/or R (Bioconductor)
- Strong understanding of molecular biology and genetics, with the ability to interpret data in a biological and clinical context
- Solid understanding of statistics and machine learning
- Experience with workflow management systems (Nextflow, Snakemake) and containerization (Docker/Singularity)
- Excellent analytical, communication, and writing skills
- English required, German is an advantage
Preferred qualifications: experience in cancer genomics, immunogenomics, transcriptomics or epigenetics, metagenomics, AI-based image analysis, data management/structured reporting, integrative multi-omics, or work in a clinical/medical environment.
What we offer
We offer an interdisciplinary position connecting interpretation and reporting of molecular diagnostic big data with clinical science at the Department of Pathology and Molecular Pathology, University Hospital Zurich within a strong collaborative framework including experts at other leading Swiss Institutions. In Zurich, you will be immersed in a dynamic, open and motivating scientific and academic environment. We are supported by intra- and extramural funding and are involved in several high-visibility national and international collaborations.
Further information
For further information, please contact PD Dr. Dr. Bettina Sobottka (annabettina.sobottka-brillout@usz.ch) or PD Dr. med. Jan Rüschoff (JanHendrik.Rueschoff@usz.ch).
We look forward receiving your application
Daniel Buschor
Recruiting
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Für diese Stelle können keine Dossiers von Personalvermittlern berücksichtigt werden. Danke für Ihr Verständnis.
Unsere Benefits
Kita vor Ort
In unseren hauseigenen Kindertagesstätten werden deine Kinder liebevoll betreut. Lange Öffnungszeiten ohne Betriebsferien und subventionierte Betreuungsplätze entlasten dich im Alltag.
Gesundheit
Wir unterstützen deine Gesundheit. Neben persönlichen Beratungen und Kursen unseres Gesundheitsmanagements, die dein Wohlbefinden fördern, bieten wir dir mit einem subventionierten Jahresabonnement beim ASVZ Zugang zu über 120 Sportarten.
Flexibilität
Wir fördern eine ausgewogene Work-Life-Balance: Knapp die Hälfte unserer Mitarbeitenden arbeitet Teilzeit, und etwa 50% der Aufgaben lassen sich im Homeoffice erledigen - wenn es dein Berufsalltag zulässt.
Familienfreundlichkeit
Wir helfen dir, Familie und Beruf zu vereinbaren. Mütter haben Anspruch auf mindestens 6 Monate Mutterschaftsurlaub (davon 16 Wochen mit vollem Lohn), Väter auf mindestens 2 Monate Vaterschaftsurlaub (davon 2 Wochen mit vollem Lohn).
Weiterbildung & Entwicklung
Wir begleiten dich auf deinem beruflichen Weg und unterstützen deine Entwicklung mit individuellen Karriere- und Weiterbildungsmöglichkeiten.
Versicherungen
Wir übernehmen 60% deiner Pensionskassenbeiträge und bieten attraktive Sonderkonditionen für Ergänzungsversicherungen.
Mobilität
Du profitierst von einem persönlichen ZVV-BonusPass zum Spezialpreis oder erhältst einen fixen Geldbetrag für ein Generalabonnement (GA) oder Halbtax PLUS.
Telefonie
Du und deine Familienangehörigen profitieren von Sonderkonditionen für private Mobil-Abonnements.
